Here is a list of all functions, variables, defines, enums, and typedefs with links to the files they belong to:

- s -

• s_buffer : ghosts.c
• saltC() : polymer.c , polymer.h
• save_last_state() : ghmc.c
• save_old_pos() : rattle.c , rattle.h
• scalar() : utils.h
• scalar_product() : statistics_correlation.c , statistics_correlation.h
• scale_vec() : elc.c , mmm2d.c
• scxcache : elc.c , mmm2d.c
• scycache : elc.c , mmm2d.c
• SELECT_TYPE_ARG1 : acconfig.h
• SELECT_TYPE_ARG234 : acconfig.h
• SELECT_TYPE_ARG5 : acconfig.h
• self_energy : mmm2d.c
• SELF_FACTOR_1 : maggs.c
• SELF_FACTOR_2 : maggs.c
• send_particles() : particle_data.c , particle_data.h
• set_molecule_trap() : topology.c , topology.h
• set_particle_dip() : particle_data.c , particle_data.h
• set_particle_dipm() : particle_data.c , particle_data.h
• set_particle_ext_force() : particle_data.c , particle_data.h
• set_particle_ext_torque() : particle_data.c , particle_data.h
• set_particle_f() : particle_data.c , particle_data.h
• set_particle_fix() : particle_data.c , particle_data.h
• set_particle_gamma() : particle_data.c , particle_data.h
• set_particle_mass() : particle_data.c , particle_data.h
• set_particle_mol_id() : particle_data.c , particle_data.h
• set_particle_mu_E() : particle_data.c , particle_data.h
• set_particle_omega_body() : particle_data.c , particle_data.h
• set_particle_omega_lab() : particle_data.c , particle_data.h
• set_particle_q() : particle_data.c , particle_data.h
• set_particle_quat() : particle_data.c , particle_data.h
• set_particle_rotation() : particle_data.c , particle_data.h
• set_particle_rotational_inertia() : particle_data.c , particle_data.h
• set_particle_temperature() : particle_data.c , particle_data.h
• set_particle_torque_body() : particle_data.c , particle_data.h
• set_particle_torque_lab() : particle_data.c , particle_data.h
• set_particle_type() : particle_data.c , particle_data.h
• set_particle_v() : particle_data.c , particle_data.h
• set_particle_virtual() : particle_data.c , particle_data.h
• set_particle_vs_relative() : particle_data.c , virtual_sites_relative.h
• set_u_equilibrium() : lbgpu.cu
• SetCallback : global_tcl.h
• setup_linear_bins() : bin_tcl.c
• setup_log_bins() : bin_tcl.c
• setup_P() : elc.c , mmm2d.c
• setup_PQ() : mmm2d.c , elc.c
• setup_Q() : elc.c , mmm2d.c
• setup_z_energy() : mmm2d.c
• setup_z_force() : mmm2d.c
• sf_print_usage() : statistics_observable_tcl.c
• SHAKE_MAX_ITERATIONS : config.h
• sigint_handler() : errorhandling.c
• sign() : constraint.c
• sim_time : integrate.c , integrate.h
• simple_momentum_update() : ghmc.c
• sinc() : utils.h
• sinp : ghmc.c
• size_of_boundindex : lbgpu.cu
• size_of_extern_nodeforces : lbgpu.cu
• size_of_forces : lbgpu.cu
• size_of_positions : lbgpu.cu
• size_of_seed : lbgpu.cu
• size_of_values : lbgpu.cu
• skin : integrate.h , integrate.c
• skin2 : integrate.c
• slab_dip_count_mu() : mdlc_correction.c
• slave_callbacks : communication.c
• SlaveCallback : communication.c
• SMOOTH_STEP : config-doxygen.h , myconfig-final.h
• smooth_step_set_params() : steppot.h , steppot.c
• SmSt_pair_energy() : steppot.h
• sock : imd_tcl.c
• soft_energy_r() : soft_sphere.h
• soft_force_r() : soft_sphere.h
• soft_pair_energy() : soft_sphere.h
• SOFT_SPHERE : myconfig-default.h , config-doxygen.h , myconfig-final.h
• soft_sphere_set_params() : soft_sphere.c , soft_sphere.h
• SOME_TAG : communication.c
• sort_int_array() : utils.h
• sortPartCfg() : particle_data.h , particle_data.c
• SPACE_DIM : maggs.c
• space_distance2 : statistics_cluster.h , statistics_cluster.c
• SQR() : utils.h
• sqrlen() : utils.h
• square_distance() : statistics_correlation.h
• square_distance_componentwise() : statistics_correlation.h , statistics_correlation.c
• square_distance_cond() : statistics_correlation.h
• square_distance_cond_chain() : statistics_correlation.h
• STAT_DEBUG : config-doxygen.h
• STAT_TRACE : debug.h
• STDC_HEADERS : acconfig.h
• stray_cut_off : modes.c , modes.h
• strcat_alloc() : utils.h
• stream : lbgpu.cu
• stretching_force_set_params() : stretching_force.h , stretching_force.c
• subt_lj_pair_energy() : subt_lj.h
• subt_lj_set_params() : subt_lj.c , subt_lj.h
• swap4() : imd.c
• swap_header() : imd.c
• sync_topo_part_info() : topology.c , topology.h